果冻学院准备广招新生，谁知开学第一天却无人报名。原来东方求败与四大恶贼在花果山上开设了忍者学院，所有人都赶去学忍术。武术不再受欢迎，即将要没落。果宝特攻去花果山理论，结果惨败在使用忍术的四大恶贼手下。一时之间，忍术所向披靡，受到整个水果世界的追捧。后来方丈在花果山突发受重伤，三剑客被冤枉诬陷，说他们是欺师灭祖的叛逆，结果三剑客被打落山崖，机甲彻底损毁，从此被整个世界谴责遗弃。三剑客在小果丁的帮助下，前去莲珠谷寻找属于自己的莲珠，并以最新的水果嫁接技术，将果宝机甲重组升级。之后他们决定重上花果山，寻找方丈被害的事实，洗刷自己的罪名越来越觉得毛利小五郎这个角色设计可能没有表面的那么简单，剧场版里也可以觉察到的处处伏笔，如果青山岗昌一开始就有意如此设计的话，那么这还蛮累的，如果是创作过程中的灵感那最终又面临媚俗，原来毛利小五郎是忍辱负重，装疯卖傻，意味深长。该怪现在人思想的超越越来越快，还是人生不过如此，却已被重复如此多遍，人们听的故事也往往更多了，又有很多人总结规律经验。所以，创新啊，期待智慧的结局。